在中医经络学说的现代研究中，日本的藤田六郎、高野千和中国的瞿养刚、吴善令、张维波等提出了“经络的体液通道论”，认为“经络是一种存在于组织间质当中的，具有低流阻性质的，能够运行组织液、化学物质和物理量的多孔介质通道”。并且用动物实验证明这种低流阻通道基本存在于皮下组织，位于脂肪层和肌肉层的结合部。这种组织液通道除有连接毛细血管和淋巴管的功能外，还有连接组织与组织的功能。许多短小的组织液通道相互沟通而形成长程大通道，即构成了中医经络学说里的经脉。张颖清在全息生物学理论的基础上进一步完善说，经络是人体神经胚胎时期由生物学特性相似程度较高的细胞群组成的纵向器官或构造的痕迹图谱。这种关于经络实质的假说，可以从胚胎发育的过程得到理解。早期胚胎经历了卵裂期、桑套期、囊胚期、原肠期和神经胚期。在神经胚期，人胚的纵向构造包括神经管、脊索、原肠、体节等。这些纵向构造是生物学特性相似程度较高的细胞群的连续。脊索发育成整体的长骨系统，其他纵向构造则发育成整体的神经、血管、淋巴、肌肉等系统。其中，至第三周末，原始心血管系统才形成并开始工作;至第五周末，淋巴系统才形成并与心血管系统一起完成物质交换的功能。在心血管和淋巴系统形成之前，胚胎的营养敷布和代谢产物的排出，通过细胞间隙中的物质扩散来实现;由物质扩散的需要形成实际的物质扩散过程，实际的物质扩散过程逐渐形成固定、原始的通道网络系统，这个系统可称之为原始的经络系统。这个原始的经络系统，亦当是由在生物学特性上相似程度较高的细胞群的连续而组成的，并且随着胚胎的发育和各组织器官的分化，而伴行于组织和器官的周围，继续发育形成联系神经、血管、骨骼、肌肉和内脏等的网络系统，即中医学里的经络系统。因此，中医学里的经络系统的功用，是由两个方面来完成的:一方面由在生物学特性上相似程度较高的细胞群的连续通道来实现，另外一方面则由非连续体液调节(包括自身免疫反应和交叉免疫反应)来实现，两者共同完成中医学所描述的经络系统的生理功能和在针灸条件下的诊断治疗作用。
然而，中医的经络学说却并不是在现代组织胚胎学和全息生物理论的基础上形成的，而是在中国先民的天人合一的哲学观念下形成的。“人以天地之气生，四时之法成，……人生于地，悬命于天，天地合气，命之曰人。"“夫四时阴阳者，万物之根本也"“阴阳者，天地之道也，万物之纲纪，变化之父母，生杀之本始，神明之府也”“其知道者，法于阴阳，和于术数”“天以六六之节，以成一岁，人以九九制会，计人亦有三百六十五节以为天地"。所谓天，是指包括肉眼所见的天空和大地在内的整个自然界。天人合一隐含着天人相对的前提，在这前提之下，还存在着天人的统一。天人统一，首先是指人是天地的产物，像天地间的其他自然事物一样，人也是天即自然的组成部分;其次，是指天即自然是人的生命存在的依据，自然的本性即是人的生命的本性，人只有依据自然的本}h}生存才能维持其生命存在，即是人合于天，而非天合于人;第三，阴阳是天与人相合的内容，天人所合之“一”，即是阴阳;第四，阴阳的对立互根，引起事物的变化发展，且由于阴阳引起的变化是有规律的，即“数”，所谓数即是有节(度)、有量的规定性，而当这种规定性被人所掌握时，就能用来为人的利益服务，即所谓“术”;第五，天人感应，人副天数，自然就是人的标本，天从根本上决定人体的结构和形式，但人类身体却在具体形成时模仿了天(即自然)的结构和形式，天人之间存在相似性和同构性。正是在这样的哲学观念之下，古人在临床经验的基础之上，总结概括出了中医的经络学说。认为像大地上有江河湖海、山脉平原和地窍洞穴将地貌联结成一个丰富多彩而俨然有生命的整体一样，人体作为一个整体也必然有个与之相似的系统将人体的各个部分联结成为一个整体，这个系统就是经络系统，既然针灸实践已经发现了众多的对于特定疾病有诊断治疗作用的点位，那么依据一定的理论将这些点联络起来成为一个系统，就势在必然，所以最终经过众多医学理论家的反复组织和完善，就出现了一个我们现在看到的能“运行气血、营养阴阳、濡润筋骨、联络脏腑、沟通表里上下”和“决生死、处百病”的经络系统。
像中医的经络学说经历了一个不断完善的过程一样，中国古人的朴素的天人合一的世界观也在被不断地理论深化，从先秦诸子的阴阳五行到宋明理学，经过佛家理论的洗礼，天人合一的观念被精致化为理一分殊的理论。
“一一事中，理皆全遍，非是分遍。何以故?彼真理不可分故。是故一一纤尘，皆摄无边真理，无不圆足，“一即多，多即一”“一即一切，一切即一“于佛一毛中即有一切佛一切处一切时，乃至一切益，如一毛孔一切遍法界诸毛孔现，皆亦如是。”“一一毛处，各有金狮子，一一毛处狮子，同时顿人一毛中”。佛教为了阐明佛的本性，使其无所不在，即既存在于所有的空间，又存在于所有的时间属性和实际状态能被理解，故而在思辨中发现了“一即一切，一切即一”的辨证逻辑和“一一毛处，各有金狮子，一一毛处狮子，同时顿人一毛中”的理事圆融、无碍具足和因陀罗网之你中有我、我中有你的交互辉映的境界，最后被总结为四法界和十玄门的理论。
宋明理学吸收佛家的四法界和十玄门理论中的精粹，结合儒道的阴阳五行理论，得出了理一分殊的概念。“万物皆有此理，理皆同出一源……物物各具此理，而物物各异其用，然莫非一理之流行也，“人人有一太极，物物有一太极’“总天地万物之理，便是太极”，太极只是一个太极。透过朱熹对理一分殊的理论总结，我们可以看到，全息胚镶嵌之说，简直就是理一分殊的理论在胚胎学领域的翻版。受精卵所携带的遗传信息就像是太极之“理”，受精卵细胞的各级有丝分裂就是“理皆同出一源”，而神经胚胎时期由生物学特性相似程度较高的细胞群组成的纵向器官则可说是“物物各具此理，而物物各异其用”了;对发育完成后所形成的人体而言，则其内部的各个细胞、组织、器官乃至系统就可谓是“人人有一太极，物物有一太极”，而“总天地万物之理，便只是一个太极”，太极只是一个太极，便是那个受精的卵细胞及其所携带的全部信息所构成的整体了。
通过上述对针刺作用机理及其哲学基础的探讨，本文可得出如下结论:中医的脏腑学说、经络学说，是以中国古代哲学思想为工具，以临床实践经验为基础，以人体粗略解音为话语形式，通过取类比象、抽象概括而形成的用以归纳总结进而解释说明中医临床经验和指导中医临床实践的理论。这个理论因为与实践保持着密切的联系，因而是与时俱进的;也因为它具有虽然朴素但却大体正确的哲学基础，因而其内容能不断地被现代科学尤其是现代医学的新发现所确证。所以，我们无须拔高它而将之神秘化，也不必贬低它而丢失了其中的宝贵内容，甚或无端地剥夺人民本来可以轻易获得的健康利益而不自知，岂不痛惜哉!
